Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms