Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP1P29466 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms