Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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