Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1P21675 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1P21675 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1P21675 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms