Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF3P15923 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF3P15923 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF3P15923 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF3P15923 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms