Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT10P13645 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT10P13645 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT10P13645 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms