Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms