Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms