Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms