Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms