Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC172P0C7W6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms