Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAVP06756 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms