Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms