Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA2O00451 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA2O00451 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA2O00451 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA2O00451 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA2O00451 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA2O00451 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA2O00451 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA2O00451 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms