Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBA1A5PL33 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms