Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXND1Q9Y4D7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms