Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms