Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX2Q9Y2T7 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms