Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms