Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms