Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HCN3Q9P1Z3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms