Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD3Q9P035 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HACD3Q9P035 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms