Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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HOXC10Q9NYD6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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