Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMPRSS4Q9NRS4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMPRSS4Q9NRS4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms