Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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