Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRHQ9HD43 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms