Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SEMA4CQ9C0C4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms