Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms