Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSPO3Q9BXY4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms