Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BBS2Q9BXC9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms