Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2Q9BX26 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms