Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NICN1Q9BSH3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms