Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA3CQ99985 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA3CQ99985 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms