Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIN3AQ96ST3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms