Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms