Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SAMD8Q96LT4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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