Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms