Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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RNF185Q96GF1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF185Q96GF1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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