Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINGO1Q96FE5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms