Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms