Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms