Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms