Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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