Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FAM71DQ8N9W8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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