Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD42Q8N9B4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms