Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CABP7Q86V35 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms