Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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