Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APTXQ7Z2E3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms