Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TPTE2Q6XPS3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms