Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SDK2Q58EX2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms